El campo de conocimiento del think tank es el de la gobernanza y las políticas públicas. La agenda de trabajo incluye, pero no se limita a, tres líneas temáticas:

Transversal no solo es un método de análisis, sino una perspectiva de la realidad. Según la Real Academia de la Lengua Española, transversal significa que se extiende atravesando de un lado a otro; que cruza en dirección perpendicular con aquello de que se trata; que atañen a distintos ámbitos o disciplinas; que estudia la estructura un problema. Transversal es uno de los mantras de la Agenda 2030 del desarrollo sostenible que plantea la necesidad de abordar los retos del desarrollo de forma integral, holística, transversal.

Transversal busca incidir en las decisiones y políticas públicas, construir capacidades individuales e institucionales, así como promover la gobernanza para el desarrollo sostenible e incluyente.

Transversal busca convertirse en la organización ciudadana más influyente de la ciudad y en una de las más relevantes del país. También busca posicionarse como uno de los principales referentes en asuntos de gobernanza y políticas locales en el debate público.

Transversal es una organización de la sociedad civil que se basa en los valores de la libertad de iniciativa, la equidad de oportunidades y el derecho al desarrollo sostenible. En Transversal creemos que las alternativas más efectivas para el desarrollo son aquellas que involucran a múltiples actores y sectores, promueven la participación y se rigen por su integridad y ética pública.